Sekjen berasal dari singkatan Sekretaris Jenderal.
Yang berasal langsung dari terjemahan Inggris "General Secretary",
yang bisa diartikan sebagai Sekretaris umum.

Sekretaris Umum PBB A.K.A General Secretary of UNO : Ban Ki Moon


Tapi mungkin karena "General" dalam bahasa Inggris bisa juga diartikan sebagai Jenderal jadinya diartikan sebagai Sekretaris Jenderal.
Suatu istilah yang gak masuk akal menurut ane.

Lalu Jenderal-nya mana, kok ada sekretaris-nya tapi gak ada jenderal-nya?